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澳门新浦京8814com:澳门新浦京8814com开发出了一款遗传图谱在线工具-MG2C

作者:晁江涛 来源:生物技术研究中心 发布日期:2021-12-16 点击: 次

近日,中国农业科学院澳门新浦京8814com烟草功能基因组创新团队开发出一款简单易用的遗传图谱在线画图工具-MG2C,相关研究成果发表在《分子园艺(Molecular Horticulture)》上。

遗传图谱可直观展示分子标记在染色体或基因组上的相对位置,不仅有助于基因功能定位与分析,也是组装基因组大片段的一大利器。目前常见的可用于绘制遗传图谱的工具MapChart、JoinMap等多为单机版,用户使用时一般需要编写代码,这对无任何编程基础的科研人员存在困难。

该团队开发了一款在线绘图工具-MG2C,用户使用时,只需参考EXCEL数据模板,准备好基因位置、染色体长度等信息后,直接复制到对应的文本框中,点击“DRAW”即可得到结果,同时提供JPG/PNG/TIFF/SVG多种格式文件下载。MG2C提供了8类33个属性参数,用户可根据需求自行调整参数。访问时建议使用谷歌、火狐、IE等支持SVG的浏览器。

中国农业科学院烟草研究所晁江涛助理研究员和李志远博士为论文共同第一作者,刘贯山研究员、王倩副研究员和晁江涛助理研究员为共同通讯作者。该研究得到了中国农业科学院烟草研究所青年基金项目、中国农业科学院科技创新工程和中国烟草基因组计划项目的共同资助。(晁江涛供稿)

原文链接:https://doi.org/10.1186/s43897-021-00020-x


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